Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Neurod1Q60867 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms