Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stxbp3Q60770 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stxbp3Q60770 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stxbp3Q60770 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stxbp3Q60770 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stxbp3Q60770 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Stxbp3Q60770 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stxbp3Q60770 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp3Q60770 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stxbp3Q60770 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms