Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mkrn3Q60764 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms