Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms