Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3aQ60520 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sin3aQ60520 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms