Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE27Q5T4F4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms