Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Specc1Q5SXY1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Specc1Q5SXY1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms