Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brip1Q5SXJ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms