Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ssh2Q5SW75 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ssh2Q5SW75 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ssh2Q5SW75 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ssh2Q5SW75 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms