Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r195Q5SVD6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vmn1r195Q5SVD6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vmn1r195Q5SVD6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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