Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp2Q5SV77 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp2Q5SV77 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms