Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Utp18Q5SSI6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms