Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46cQ5SSF7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Fam46cQ5SSF7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Fam46cQ5SSF7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Fam46cQ5SSF7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46cQ5SSF7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms