Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85aQ5SP85 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85aQ5SP85 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms