Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss11eQ5S248 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms