Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms