Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CoblQ5NBX1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CoblQ5NBX1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CoblQ5NBX1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CoblQ5NBX1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CoblQ5NBX1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CoblQ5NBX1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CoblQ5NBX1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms