Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ecm2Q5FW85 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ecm2Q5FW85 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms