Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm3Q5F4S9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms