Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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