Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Spag9Q58A65 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Spag9Q58A65 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Spag9Q58A65 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Spag9Q58A65 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spag9Q58A65 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms