Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmtc2Q56A06 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmtc2Q56A06 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmtc2Q56A06 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms