Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

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Length 1,219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Adamts18Q4VC17 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Adamts18Q4VC17 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms