Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhox3aQ4TU90 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms