Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms