Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms