Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms