Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms