Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms