Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms