Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms