Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms