Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms