Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms