Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc4Q3UP44 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms