Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms