Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms