Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BtrcQ3ULA2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BtrcQ3ULA2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms