Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edc4Q3UJB9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Edc4Q3UJB9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms