Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm648Q3UJ22 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms