Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx3lQ3UIR3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dtx3lQ3UIR3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms