Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtcl1Q3UHU5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtcl1Q3UHU5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms