Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms