Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed8Q3UHI4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed8Q3UHI4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms