Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LchnQ3UHG7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms