Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms