Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3aQ3UFY4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms