Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms