Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms