Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VwceQ3U515 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms